东北红豆杉育苗有用种子育苗和扦插育苗两种方法。用种子育苗生产周期太长，所以多采用扦插育苗方法。扦插育苗具有下列特点。
（一）开花结果早
因为插穗是从大树上采取的，故具有大树基因，培育的幼苗具有与大树相同的成分，而且开花结果早，插穗后第五年就有部分树苗开花结果，药物与造林及作盆景价值高。
（二）出圃快
插穗长15cm，成活后当年小苗的高度就可达10cm，第2―4年植株最高生长量可达15cm，第五年植株最高生长量可达37cm。因此出圃快。
（三）树型多样
扦插苗树形多样，可适应不同的需求，树型中扇形占多数，为标志树形。丛形、自然开心型、奇颖形占少数。
1、扇型：侧枝在主枝上成1个平面向2个方向展开，型如扇子。
2、丛型：没有主枝，从根部发出若干个枝条。
3、自然开心型：侧枝在主枝上想各个方向展开。
4、奇颖型：侧枝向1个方向展开，树型奇颖。

二、 扦插方式

（一）营养盒内
采用12cm×12cm的塑料营养盒，基质为掺入1／2河沙的腐殖土，按10盒1排摆放成长方形营养盒苗床。
（二）花盆内
采用口径为16cm的花盆，基质为掺入1／2河沙的腐殖土，按照6―8盆1排摆放成长方形花盆苗床。
（三）露地
选择富含腐殖质，排水良好，管理方便的地方作为苗床。将土壤翻深20cm，拣出杂物，耕细，上层掺入1／2河沙，河沙层厚10cm左右，然后作苗床，床高15―20cm，步道宽40cm，整平床面。
将基质浇透水，结合浇水进行土壤消毒，加入多菌灵（5―8g／m2）或高锰酸钾。这些工作应在扦插前5天完成。
为了实验不同基质对扦插成活率的影响，实验时设三个区：1区土壤中掺入1／2河沙;2区土壤中掺入少量河沙;3区土壤中没掺入河沙。各区的成活率：1区95%，2区60%，3区31%。结果表明以掺入1／2河沙的基质最好。
上述工作完成后，等待扦插。

三、插穗的选取处理

1－3年生已木质化的枝条均可做插穗，其中已木质化的1－2年生枝条生根率最好。主枝、侧枝、或是剪断过顶梢的中间枝，都能愈合生根。中间枝，多年生红褐色枝条扦插生根率低，生根后生长发育不良，从顶部长出2－3条近于水平展开的侧枝，形状差。
春季扦插前采取枝条要注意保湿，防止风吹日晒脱水。扦插时间以5月下旬最好。枝条采取后，要剪成长8－10cm（1年生），10－15cm（2年生）的插穗，短些也可以，但短的影响出圃时间。将插头部位3cm处的叶片剪除，扎成捆，每捆50根。扎捆时注意对齐插头，将等长的插穗捆在一起。扎捆后及时放入处理液内。
用缓农春露溶液泡插头，每支兑水7.5kg，水温不低于5℃，将插穗捆竖立浸泡，浸泡深度不得超过3cm，浸泡12－18小时。

四、曼地亚红豆杉的扦插方法

在5月下旬至6月上旬春夏之交进行扦插，插深为插穗长度的1／3左右。每个营养盒或花盆内只扦插一个插穗，在露地扦插时株行距为5×10 cm。用刀头插入土中撬一窄缝，然后将插穗放入，用力挤紧压实。要将同树龄，等长的插穗分别插在同一床内（营养盒内、花盆内），然后浇透水。注意不能插的过深，苗床上不能有积水。

五、保温、保湿与遮阳

床面上安放竹片拱架，拱架顶部与床面的距离为50－60 cm，拱架上覆盖塑料薄膜，薄膜上用70％遮光率的塑料遮阳网遮阳，四周用砖压住，在营养盆内、花盆内扦插，如数量很少，可在各盒、盆内安插树枝拱架，套上白色塑料方便袋后放在树荫下。

六、插穗生长发育情况

15－18天，插头变粗，开始出现根瘤。有的插头腐烂，在烂掉部分上边仍能长出根瘤。28天左右普遍形成根瘤。30－45天大量生根，根又白又粗，俗称水根。刚生根时只有1－2条，以后逐渐增多。根生在根瘤上，有的插穗2处生根，另一处生在贴地面处。70－80天，有的根长达50mm，有的刚生根，个别的100天左右才生根。有的插穗长出根瘤但不生根，没长根瘤的插穗，有的30天左右叶片变黄，枝条枯干，有的10个月后才枯干。如管理的好，生根率可达95％。
插穗成活后，第一年基本不生，第二至四年植株最高生长量可达15cm，最高可达50cm。第五年生长的快，植株最高生长量可达37cm，最高可达76cm。
从大树上采取的插穗，插后第一、第二年带花蕾，但做不住果。第三，第四年不见花蕾。第五年有部分苗结果。东北红豆杉雌雄异株，雄株春天开花但不结果，雌株秋天结果，8月份果实变红。